关于国库管理，财政部和央行的关系一直存在争议。
正在公开征求意见的《预算法》修正案（草案）二次审议稿中，将现行预算法“中央国库由中国人民银行经理”一条删除，引发外界诸多讨论。
现行预算法“各级政府应当加强对本级国库的管理和监督”的条文，改成二审稿中“各级政府及其财政部门应当加强对本级国库的管理和监督”。现行预算法与二审稿中，都有“各级国库库款的支配权属于本级政府财政部门”。
这些有关国库管理条文的改动，意味着中国人民银行对国库管理权限的减弱，而财政系统这方面的权限则得到加强。
财政部财政科学研究所副所长王朝才指出，世界上没有几个国家是央行经理制。在现行经理制下，财政资金拨付过程中，还需要走央行的审批程序，需要他们相关负责领导签字通过，这往往会减缓财政资金下达的速度。因此央行代理制似乎更为合适。此前，财政部曾就预算法的修订，向各地征求意见。据媒体报道，广东、四川等省份，均明确提出，由央行经理国库已经不合时宜，建议在资金的收缴、支付上，实行央行代理制；避免财政系统与央行出现职能交叉，影响财政资金运行的效率。
（《21世纪经济报道》7.26 周潇枭）
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