我科学家主导完成黄瓜全基因组测序

    本报北京11月2日电(记者胡其峰)为什么黄瓜闻起来有一股清香味?今天在中国农科院宣布完成的黄瓜全基因组测序精细图能为你揭开其中的奥秘:这是因为黄瓜体内的脂氧化酶基因家族在起作用。作为由我国科学家发起和主导的国际基因组计划所取得的重要成果,11月1日的国际《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志在线发表了关于黄瓜全基因组测序完成的论文。

    我国瓜类作物的栽培面积在4000万亩以上,仅黄瓜的产量就占世界的一半。作为世界第一个蔬菜作物的基因组测序和分析科研成果,黄瓜全基因组测序的完成对黄瓜和其它瓜类作物的遗传改良、基础生物学研究,以及对植物维管束系统的功能和进化研究将发挥重要的推动作用。

    该计划首席科学家、蔬菜花卉研究所研究员黄三文介绍,黄瓜基因组共有约3.5亿个碱基对。参与计划的科研人员自主开发了一套全新的序列拼接软件,以较低成本成功绘制了黄瓜基因组的精细图,研究表明:黄瓜7条染色体中的5条是由甜瓜的12条染色体中的10条两两融合而成的,这一发现解决了葫芦科染色体进化上一个多年未解的难题。在基因区域,黄瓜和甜瓜有95%的相似性,和西瓜也有超过90%的相似性。这一套测序策略已经成为其他植物基因组测序的模式。

    国际黄瓜基因组计划由中国农科院蔬菜花卉研究所于2007年初组织发起,是由我国发起的第一个多边合作的大型植物基因组计划。参与单位包括中国农大、北师大、美国康乃尔大学、威斯康星大学和加州大学戴维斯分校、荷兰瓦赫宁根大学以及澳大利亚多态性芯片技术中心。