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    光明日报 2014年07月18日 星期五

    科技前沿

    人类肠道微生物大清点

    最高质量参考基因集数据库问世

    吴春燕 祝和平 《 光明日报 》( 2014年07月18日   06 版)

        本报讯(记者吴春燕 通讯员祝和平)人类的肠道是一个庞大的“社区”,这里的“居民”由大约1000到1150种细菌构成。细菌数量极大,是人体细胞总数的10倍。这些肠道菌群与人体互利共生,人体为微生物提供生存场所和营养,而微生物则为人体产生有益的物质,并保护人类健康。但是,目前对这些“居民”的基因信息“登记”还很不完善,影响相关研究的深入进行。

        7月7日,华南理工大学生物科学与工程学院2011级微生物学专业博士研究生李俊桦作为第一作者,华南理工大学作为第三完成单位,深圳华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位共同合作完成的《人肠道微生物组参考基因集》研究成果在《自然·生物技术》上公开发表。这是基因组科学创新班学子在国际顶级学术期刊上以第一作者身份发表的第二篇文章,也是在《自然》杂志上首次以第一作者而非并列第一作者身份发表的首篇文章。

        科研人员在该研究中基于249个新的测序样本和之前已公布的1018个人体肠道微生物样本,加上511株与人肠道密切相关的已测序原核微生物的基因组信息,构建了一个高质量、近乎完整的人类肠道微生物基因集数据库。该项目中的样本来自欧洲、美洲和亚洲,比之前用于构建的类似数据集的样品规模至少大三倍,是迄今为止最具代表性、最高质量、近乎完整的人类肠道微生物参考基因集数据库,为进一步研究人类肠道微生物提供了全面而精准的数据支持,对推动不同人群之间肠道微生物的遗传变异研究以及人类健康和疾病相关研究具有重要意义。

        作为华大基因该项目负责人,李俊桦表示:“更具代表性和高质量的人类肠道微生物参考基因集数据库有利于我们用量化的角度,通过宏基因组,宏转录组以及宏蛋白组等方法,了解肠道微生物菌群在不同人群中的差异情况,从而理解它们在人类健康和疾病中的重要作用。”

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