鲤鱼全基因组序列图谱绘制完成

    本报北京5月6日电(记者 董山峰)今天,中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所共同实施的“鲤鱼基因组计划”在京宣布成功完成鲤鱼全基因组测序,并绘制鲤鱼基因组框架图谱、基因组物理图谱和高密度连锁图谱。专家指出,这是中国渔业科技和生物基因组技术的重大突破。

    鲤鱼全基因组测序难度和水平在哪里?美国奥本大学农学院副院长刘占江等专家指出,鲤鱼基因组有100条染色体,是目前完成全基因组测序研究物种中染色体数目最多的动物。此次发布的鲤鱼基因组框架图,是以中国养殖最广的鲤鱼品种的雌核发育纯系单个个体为测序对象,测定了超过100倍覆盖率的高质量数据。在鱼类基因组图谱装配各项参数上达到了国际领先水平。

    为什么要选择鲤鱼进行全基因组测序?中国水产科学研究院生物技术领域首席科学家孙效文说,我国是世界上鲤鱼种质资源和基因组资源最丰富的国家。鲤科鱼类也是我国最重要的水产养殖种类,年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上。鲤鱼还是目前我国培育出品种最多的水产养殖种,在以利用基因组资源改良动植物经济性状为特征的现代农业育种技术发展过程中,鲤鱼是我国最有条件利用基因组资源进行品种改良的水产养殖物种。

    鲤鱼全基因组测序结果不仅对鲤鱼基因组辅助育种研究,快速培育抗病、抗逆、优质、高产的优良品种提供重要基础,而且对鲤科鱼类物种进化和种类分化的阐明也具有重要价值。

    据悉,2009年底,中国水产科学研究院联合相关单位启动了“鲤鱼基因组计划”,经过1年多的刻苦攻关,于今年4月底成功完成了上述成果。专家还指出,鲤鱼全基因组序列图谱绘制完成,标志着我国鲤鱼分子育种等相关研究正式进入基因组时代,有望推动鲤鱼育种技术和渔业科技的全面进步。